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Q-TOF Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS/MS) (No:S2212318)

Experimental appointment
Name
Q-TOF Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS/MS)
Type specification
Agilent 6546
Manufacturer
Agilent
Start date
2022-05-05
Affiliated unit
Analysis and Testing CenterChromatography-Mass Spectrometry Room
Instrument manager
高老师 Test consulting
Installation site
L2-230
Contact information
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灵敏度

  • ESI MS正离子模式：柱上进样1 pg 利血平连续10针进样，考察母离子609.2807 m/z， S/N> 500: 1；

  • ESI MS/MS正离子模式：柱上进样1 pg 利血平考察子离子174, 195, 397, 448 m/z， S/N> 15000:1；

分辨率

> 59,000 @ 2722 m/z

动态范围

大于5个数量级

MS模式质量精度

正模式：< 0.8 ppm(m/z 609.2807)；负模式：< 0.8 ppm (m/z 391.0051)

质量范围

TOF 部分：50-10000m/z

质量精度的温度稳定性

当室温漂移 < 3 C时，质量精度维持1 ppm

采样速度

每秒扫描45张谱图

适用

适用于100%有机相到100%水相，耐用一定浓度的缓冲液

配置
    2. 超高效二元高压泵；
    4. 超高效自动进样器；
    6. 超高效多功能柱温箱；柱温范围：可降温，4C -108C;
    8. Q-TOF 6546四极杆飞行时间质谱仪（含ESI源，APCI源）；
    10.  代谢组学分析软件及谱库（含Pathway分析软件）；
    12. 蛋白及生物多肽等大分子分析软件；
数据采集模式

  • 1.     全扫描（SCAN）

  • 2.    选择离子扫描（SIM）

  • 3.    数据相关(Data dependent)扫描功能：离子排除与优先离子选择扫描功能；智能碎裂能量选择功能；优先价态选择扫描；

  • 4.    目标离子的质谱/质谱采集(target MS/MS): 针对筛查出来的目标化合物进行结构分析和确定

  • 5.     自动的质谱/质谱采集(auto MS/MS): 根据设定的阈值，自动选择母离子进行二级碎裂，同时得到含有精确质量数信息的母离子和子离子；

  • 6.    All IonMS/MS (AIM): 在一次采集中，自动设置高中低三个不同能量的源内碰撞诱导裂解电压或者三个不同能量碰撞池电压，同时采集母离子和子离子的信息；

软件功能

  • 1.数据定性分析

  • 1.1.  能同时处理多组数据

  • 1.2.  分子特征提取(MFE)功能从海量数据提取化合物峰

  • 1.3.  自动计算每个峰的化学式(MFG)，计算同位素比

  • 1.4.  数据相关模式的MS/MS谱化合物找寻功能

  • 1.5.  质量精确度，同位素比来确定最终化学式

  • 1.6.  未知物结构推导与解析功能(MSC)

  • 2     统计学数据处理与分析

  • 2.1.  能够自动对多个或多组数据进行全面的多变量和单变量统计分析

  • 2.2.  可以使用方差分析 (ANOVA)、主成分分析 (PCA)、偏最小二乘分析（PLS-DA）、聚类分析、火山图、层次聚类、类预测以及用户自己编写的R脚本进行统计学差异分析；

  • 2.3.  能够自动进行生物通路分析，包括经典的Pathway分析和自动构建生物代谢通路功能，并且能自动将经典代谢通路上有而实验中未发现的生物标记物自动生成数据库，以进行靶标组学分析。Pathway分析能整合多组学信息（基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等），并标注在同一张通路图中，便于用户发表文章使用。

  • 3  代谢组学数据库：收录79000+代谢物的精确质量数据库，其中9000+化合物有精确质量数二级质谱图；

  • 4 蛋白质及多肽鉴定软件：

  • 4.1.  处理复杂的完整蛋白质混合物分析，可以快速发现样品中的蛋白质并计算分子量；

  • 4.2.  独特的分子特征发现和解卷积算法（MFE）专门用于小分子的分析，如合成肽和蛋白质酶解物

  • 4.3.  氨基酸序列编辑器，可以轻而易举地进行序列设定和已知类型修饰的定义（全局修饰或位点特异性修饰，固定修饰或可变修饰）；

  • 4.4.  序列匹配器，加速了预期蛋白质确认和非预期序列修饰的鉴别；

应用
  • 高分辨率、高质量准确度、高灵敏度的四级杆飞行时间质谱仪，是强极性、大分子、难挥发的有机化合物强有力的定性、定量分析工具。结合超高液相色谱仪。在一次分析中可以获得复杂样品的全面分析，适用于中药复杂成分鉴定、代谢组学和药物代谢的研究，如血样、尿样等生物样品的代谢物鉴定，中药提取物、食品等复杂成分分析，有机合成化合物的精确分子量及分子式测定，环境污染物降解物分析等；

  • 1. 对于普通有机化合物的定性分析。通过精确的分子量测定（MS），利用同位素算法或Database检索找到可能的化合物分子式并给出得分。然后，再通过MS/MS数据检索化合物Database或Library获得结构信息。

  • 2. 对于蛋白质、多肽等高分子化合物的定性分析，通过ESI多电荷分析，在获得精确MS和MS/MS的基础上，利用专业软件进行解卷积得到准确分子量，或者通过MS/MS检索离子碎片来确定氨基酸序列，比对蛋白质数据库鉴定蛋白质。而对于需要寻找高度关联的差异性分析的蛋白质组学、代谢组学等样品，通过一系列对比样品的MS和MS/MS，利用软件进行定性分析。

  • 3. 定量方面，精确的质量数可以很大程度降低基质效应的干扰，标样和样品基质同化的外标法准确度大大提高。内标法更佳。

送样须知
  • 1. 清楚告知检测人员检测目的、预期分析结果及样品详细信息（包括但不限于分子式结构式）等。指定分析方法或参考分析方法请发送到系统邮箱；

  • 2. 本中心只对所送样品负责。溶解好的样品请标明溶剂，固体或粉末样品，请说明溶解性能或溶剂；

  • 3. 液体样品送样量1-5ml左右，浓度最好在ppm级, 过0.22um膜；固体样品5mg左右；

  • 4. 用于鉴定的多肽或蛋白质样品，纯度不应小于95%；

  • 5. 有毒、害的样品须特别说明；其它特殊样品特殊处理。

序号 仪器测试收费项目 费用类别 单位 校内收费标准 校外收费标准 备注

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